A Faculdade de Medicina Veterinária é uma unidade orgânica da UJES, criada à luz do Decreto nº. 07/2009 de 12 de Maio. Situa-se no Bairro Santo António no Município do Huambo, Sector Comandante Nzaji, e está vocacionada para graduação e pós-graduação nas áreas de Medicina Veterinária e Aquicultura.

A Faculdade tem convênio com a Faculdade de Medicina Veterinária da Universidade do Chile (cooperação académica mútua no ensino, extensão e gestão universitária) e com o Instituto de Investigação Veterinária de Angola (cooperação académica, técnica e de pesquisa científica).